AccuYeast™ Build Strain

AccuYeast Strain Build는 yeast genome integration과 episomal plasmid engineering을 지원하는 맞춤형 서비스입니다. Genome integration의 경우 knock-in, knock-out, knock-down과 같은 유전자 편집이 가능하며, episomal plasmid engineering을 통해 yeast 내에서 유지·발현되는 plasmid 제작도 함께 제공됩니다.

Genome integration은 외래 유전자를 yeast 게놈의 특정 위치에 삽입하거나 기존 유전자를 제거·변형하는 방식입니다. 반면 episomal plasmid engineering은 게놈에 삽입하지 않고, yeast 내에서 독립적으로 복제되는 plasmid를 이용해 유전자를 발현합니다. 연구 목적과 실험 설계에 따라 두 방식 중 적합한 옵션을 선택할 수 있습니다.

• Knock-in: 특정 유전자를 yeast 게놈의 목표 위치에 삽입하는 방식
• Knock-out: 표적 유전자를 제거하여 기능을 상실시키는 방식
• Knock-down: 유전자의 발현 수준을 감소시키는 방식

Order Form의 Desired Editing Type 항목에서 원하는 편집 방식을 지정할 수 있습니다.

본 서비스는 고객이 제공한 yeast 균주를 사용하여 진행됩니다.

제공된 균주를 기반으로 genome integration 또는 plasmid engineering을 수행하며, 균주 제공 및 배송 방법에 대한 자세한 사항은 주문 과정에서 안내드립니다.

Genome integration을 진행할 경우, 고객은 편집을 원하는 yeast 게놈상의 target locus를 지정하게 됩니다. Homology arm (HA)은 표적 위치와의 상동 재조합을 위해 사용되며, 게놈 기반 HA 서열은 기본적으로 제공됩니다. 특수 서열이 필요한 경우 별도 협의가 가능합니다.

네, 가능합니다.

고객이 직접 DNA 서열을 제공할 수도 있으며, 필요 시 BIONEER의 Gene Synthesis 서비스와 연계하여 서열 설계부터 yeast strain 제작까지 연속적으로 진행할 수 있습니다. Gene Synthesis는 선택 사항이며, Order Form의 Gene Synthesis Option 항목에서 요청 여부를 지정할 수 있습니다.

DNA cassette는 genome integration 또는 plasmid engineering 목적에 맞게 설계됩니다. Genome integration의 경우, 좌우 homology arm과 함께 삽입될 ORF, promoter, terminator, selection marker 등이 포함될 수 있습니다. Cassette의 전체 크기(bp)는 Order Form에 필수로 기재해야 하며, 전체 서열을 제공하거나 일부 구성 요소만 지정하는 것도 가능합니다.

제작된 yeast strain은 colony PCR 및 Sanger sequencing을 기본 QC 항목으로 하여 유전자 삽입 또는 편집 여부를 확인합니다. 삽입 서열의 길이가 길거나 구조 확인이 필요한 경우에는 NGS 분석을 통해 전체 서열을 추가로 검증할 수 있습니다. QC 범위는 주문 내용과 cassette 구성에 따라 사전 협의됩니다.

완성된 yeast strain은 Agar type 또는 Glycerol type 중 선택한 보관 형태로 제공됩니다.

• Agar type은 효모 균주를 영양분이 포함된 고체배지에서 배양한 뒤, 생장을 억제하기 위해 4°C 조건으로 보관하여 전달하는 방식입니다.
• Glycerol type은 액체배양된 균주에 glycerol을 30% (v/v)로 처리한 후 동결 보존(-70°C)이 가능하도록 준비하는 방식입니다.

배송 시에는 아래와 같은 형태로 제공되며, 주문 시 원하는 shipping type을 선택할 수 있습니다.

• Agar type: Rich medium + supplements solid medium (2.0 mL microtube)
• Glycerol type: Rich medium + supplements + 30% glycerol liquid medium (2.0 mL microtube)