S. pombe Haploid Deletion Mutant Set ver 5.0 5Y License (3,420 strains)

Yeast genome-wide knockout libraries

본 제품은 유전자 적중 방법으로 제조된 세계 유일의 분열효모 유전자 결손 라이브러리로서 (Nature Biotech., 2010), 총 haploid 3,420 deletion mutants로 구성되어 있으며, 유전자 결손 시 나타나는 phenotype을 바탕으로 유전자 기능 분석 뿐 아니라, 약효 반응 분석을 통한 작용 기전 및 신약 타겟 규명 연구에도 효과적으로 적용 가능 합니다. (M-5030H-LT와 동일한 제품으로, 5년 동안만 사용하는 제품입니다.)

₩15,000,000
카탈로그 번호
M-5030H-5Y

특장점

  • S.pombe 각각의 유전자의 deletion mutants로 구성

  • 포유 동물과 생리학적인 프로세스 유사

  • 인체 암 유전자와 30% 이상의 상동성

  • 세포 주기가 짧아 (~3h) 분자생물학적인 작용 기전 및 pathway 연구에 용이

  • 열성 형질에 따른 phenotype 분석이 가능

  • functional complementation을 바탕으로 알려지지 않은 유전자 기능 분석이 가능

  • 살아있는 세포 기반의 대용량 약물 작용점 스크리닝에 이용 가능

개요

분열효모 게놈 적중 라이브러리는 바이오니아, 한국 생명공학연구원 (KRIBB) 및 영국 왕립 암연구소 (Cancer Research UK)의 공동 연구로 개발되었으며, 바이오니아가 독점 사업권을 갖고 있습니다. 분열효모 게놈 적중 라이브러리는 규모 유전자 기능 분석, 약물 작용점 규명 및 검증 연구, 총괄적인 세포 기능 연구의 강력한 연구 수단입니다. 또한, 유전자 발현 및 합성치사(synthetic lethal) 분석 등과 같은 유전자 기능 분석 및 약물 스크리닝에 사용될 수 있습니다. 분열 효모는 인간을 포함한 포유동물과의 유전자 상동성이 발아효모보다 높고 세포 분열방식 역시 포유 동물과 유사하여, 보다 이상적인 모델 생명체로 여겨지고 있습니다. 그래서 분열효모 게놈 적중 라이브러리는 상동성 재조합을 통해 표적 유전자를 KanMX4를 포함한 selection 카세트로 치환하는 방식으로 제조되었습니다.

- Heterozygous diploid deletion mutants 라이브러리의 경우 총 4,845개의 변이체로 구성되어 있고 이는 전체 게놈 (총 4914개 ORF 포함)의 약 98%를 차지합니다.
- Homozygous diploid deletion mutants 라이브러리의 경우, 총 3,420개의 변이체로 구성되어 있습니다.

각 균주들은 특이적인 barcode를 selection 마커 (KanMX4) 양쪽에 지니고 있으며, 이는 전체 균주 pool상에서 다량의 유전자 기능 분석 및 약물 타겟 스크리닝이 용이한 수단을 제공하고 있습니다. 또한, 각 개별 균주의 표현 형질을 분석함으로서 유전자의 기능을 규명하는데도 효과적으로 사용 가능합니다.

figure1


응용 분야


응용 분야 #1 (Anti-fungal)

figure2

Figure 1. 항균제인 terbinafine을 전체 라이브러리에 처리하여 부작용 제거에 사용할 수 있는 erg1 유전자 이외에 Terbinafine의 신규 타겟으로서 pmm1 유전자를 새로 발굴



figure3

Figure 2. 분열 효모인 S. pombe 시스템은 발아 효모인 S. cerevisiae 시스템보다 Terbinafine의 민감도가 1,000배 이상 높게 나타남.
(Pombe 유전자가 이 항균제에 더 특이적인 것을 알 수 있음)




응용 분야 #2 (Anti-hyperlipidemic)

figure4

Figure 3. 고지혈증 치료제 simvastatin의 작용점인 HMG1 유전자가 분열 효모인 S. pombe에서 타겟으로 발굴되었고, 발아 효모인 S. cerevisiae에서는 확인되지 않음.
(S. pombe가 이 고지혈증 치료 약물 스크리닝에 더 효율적인 것을 알 수 있음)




응용 분야 #3 (General toxicity)

figure5

Figure 4. 독성을 나타내는 Troglitazone은 분열 효모에서 약 10 uM 농도에서 독성을 나타내었고, 안전한 약물인 Rosiglitazone은 독성을 나타내지 않았음.
(신약개발 초기 단계에서 일반 독성 평가를 하는데, 이를 통해 약물개발 지속여부에 관한 결정 시간 (decision time) 단축, 부작용에서 비롯되는 리콜 사태 예방 등에 분열 효모 시스템을 효과적으로 사용할 수 있다는 것을 의미)

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