Single Gene qPCR Primer Set

Single Gene qPCR Primer Set은 real-time PCR 분석에 사용하는 dsDNA binding dye type의 primer를 MIQE(Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments) guideline*에 따른 검증을 진행 드리는 서비스입니다.

분석하고자 하는 Gene 정보를 제공해주시면 MIQE guideline*에 따른 primer design 및 target specificity와 PCR efficiency를 검증하여 200rxn의 primer set로 제공해 드립니다. 또한, 보유 primer 서열 대상으로 검증 서비스를 제공 드립니다.

이는 별도의 검증 없이 실험에 바로 사용 가능하여 ready-to-publish data를 도출하실 수 있습니다.

* The MIQE Guidelines [Bustin, S.A., et al. 2009. The MIQE Guidelines: Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments, Clinical Chemistry 55:4, 611-622]

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카탈로그 번호
S-6042-S200
  • Single Gene qPCR Primer Set는 MIQE guideline에 따른 필수 조건을 만족하는지 확인하기 위한 검증 실험을 수행 후 primer set를 제공 드리는 서비스로 별도 검증 없이 간편하게 실험에 사용 가능하여 primer optimization에 소요되는 시간을 절감할 수 있습니다 (Table 1).

 

MIQE Guideline란?

MIQE (Minimum Information for Publication of Quantitative Real-time PCR Experiments) Guideline* 는 qPCR 실험의 신뢰도와 정확도, 재현성 등을 판단 및 평가할 수 있도록 실험 전 과정에 거친 단계별 checklist를 제시한 qPCR 실험의 지침 기준입니다. 해당 서비스는 실험 정보를 고객분께 제공하며 이를 통하여 결과의 유효성을 평가할 수 있습니다.

 

Item to check

Specificity (gel, sequence, melt, or digest)

For SYBR Green I, Cq of the NTC

Calibration curves with slope and y intercept

PCR efficiency calculated from slope

r2 of calibration curve

Linear dynamic range

Cq variation at LOD

Evidence for LOD

Table 1. MIQE guideline의 qPCR validation 항목 중 필수 정보.

The MIQE Guidelines [Bustin, S.A., et al. 2009. The MIQE Guidelines: Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments, Clinical Chemistry 55:4, 611-622]

Figure1. Human ACTB의 target과 NTC(No-template control)의 Dissociation curve, Dynamic range, standard curve, 그리고 전기 영동 이미지.

* Single Gene qPCR Primer Set는 ExiCycler™ 96 V3와 2X GreenStar™ qPCR Master Mix (-ROX Dye)(K-6253)로 검증됩니다. 때문에 타사 제품을 이용할 경우 결과에 차이가 있을 수 있습니다.

Applications

Applicable to Quantitative Real-time PCR


Primer specificity

• Primer blast 및 자사 bioinformatics tool을 이용한 표적 특이적 primer 디자인

• Self primer-dimer 형성 서열 배제

• Dissociation curve에서 단일 peak 확인

• Gel 전기영동에서 단일밴드 확인

• 70 ~ 150 bp의 짧은 amplicon size

 

 

Figure 1. Primer validation result (Example. RPL13A gene).

 

 

Wide linear dynamic range & high PCR efficiency

• 102 ~ 107 copies의 광범위한 증폭 범위 • MIQE Guideline을 준수하는 90 ~ 110%의 qPCR 증폭 효율

 

 

Figure 2. [BIONEER] Dynamic range & PCR efficiency (Example. GAPDH gene).
MIQE guideline에서 권고하는 qPCR efficiency 범위(100%±10%)에 해당.
Limit of detection (LOD) 100 copies 이하 확인.

 

 

Figure 3. [Competitor] Dynamic range & PCR efficiency (Example. GAPDH gene).
MIQE guideline에서 권고하는 qPCR efficiency 범위(100%±10%)에 해당.
103과 102 copies 사이에 불규칙적인 간격이 관찰되며 이는 limit of detection (LOD) 값이
103 copies 이하로 자사 대비 detection 효율이 떨어짐.

Manual

 

 

MSDS

 

 

Quality Assurance

Bioneer is the holder of Quality Management System Certificates for the following standards.

• ISO 9001 - certificate

1. 서비스 비용

Cat. No.

Product Description

Price

S-6042-S200

Single Gene qPCR Primer Set

∙보고자 하는 유전자 정보 제공하실 경우

170,000원/Gene

∙보유하신 primer 서열을 제공하실 경우

150,000원/Gene


Cat. No.

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* Single Gene qPCR Primer Set은 위 제품에 최적화 되어 있습니다.

 

 

2. 서비스 의뢰 방법

Single Gene qPCR Primer Set Order Form 을 작성하여 qPCRarray@bioneer.com으로 보내주시기 바랍니다.

 

 

3. 상담 안내

  상담시간: 평일 오전 9:00 ~ 오후 6:00 (주말, 휴일 휴무)
  전화상담: 042-930-8673 (유전자발현분석팀)
  e-mail: qPCRarray@bioneer.com
  주소: 대전광역시 대덕구 문평서로 8-11 ㈜바이오니아 유전자발현분석팀

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