ExiProgen™

ExiProgen™은 DNA부터 단백질을 전자동으로 합성하는 장비입니다. 단백질을 coding 하는 DNA와 단백질 합성키트를 장착하고 ExiProgen™을 가동시키면, in-vitro transcription과 translation을 자동으로 수행합니다. 이렇게 생성된 단백질을 affinity chromatography법을 이용하여 자동 정제함으로써 90% 이상의 순수한 단백질을 6시간 내에 얻을 수 있으며, 한번에 최대 16종까지 만들어 낼 수 있습니다. 또한 세포주에서 높게 발현된 affinity tagged protein을 고순도로 정제할 수 있습니다.                                                                                                 

 Application Note

• ExiProgen™ Application_Fluorescent proteins

• ExiProgen™ Application_High molecular weight protein

• ExiProgen™ Application_in vivo protein expression pET vectors

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카탈로그 번호
A-5041

개요

단백질 합성 및 정제 원리

ExiProgen™ Protein Synthesis Kit는 다양한 단백질을 효과적으로 합성시킬 수 있도록 최적화된 reagent와 합성된 단백질의 정제를 위한 reagent 및 Ni-NTA magnetic bead로 구성되어 있습니다. Recombinant plasmid DNA로부터 합성된 타겟 단백질은 Ni-NTA magnetic bead에 의해 수집된 후 세척 용액에 의해 세척되어 고순도의 단백질로 정제됩니다.

핵산 추출 원리

ExiProgen™ DNA/RNA Kit는 다양한 샘플 시료로부터 효과적으로 핵산을 추출할 수 있도록 최적화된 reagent 및 silica magnetic bead로 구성되어 있습니다. 샘플 시료로부터 용출된 핵산은 silica magnetic bead에 의해 수집된 후 세척 용액에 의해 세척되어 고순도의 핵산으로 추출됩니다.

제품 기능

  • Fast protein production
    약 6시간 내에 gene 으로부터 순수한 단백질을 수득

  • DNA/RNA Purification
    동물, 식물의 혈액이나 조직 등 다양한 생체시료로부터 genomic DNA 자동정제

  • Affinity protein purification
    Affinity tagging된 단백질을 순수하게 자동 정제

특장점

  • 최적화된 핵산 및 단백질 합성 프로토콜 내장

    다양한 시료(whole blood, tissue, cell, bacteria, plant 등)와 타겟에 최적화된 단백질 합성 및 핵산 추출/정제용 프로토콜이 내장되어 있어 사용하기 편리하며, 재현성 높은 결과를 얻을 수 있습니다.

  • 단백질 변성 방지를 위한 저온 유지

    장비 내부에 장착된 cooling reaction block은 elution tube rack을 10℃ 이하로 유지시킬 수 있어 열에 의한 단백질 변성을 최소화하였습니다.

  • 고순도 핵산 추출 및 단백질 정제

    장비에 장착된 자성블록은 자성입자들을 균등하고 빠르게 부착시켜 고순도, 고효율로 핵산 추출 및 단백질 정제를 수행할 수 있습니다. 히팅블록은 핵산 추출 시 elution 효율을 높이면서 알코올를 완전히 증발시킬 수 있는 기능을 갖추고 있습니다. (한국등록특허 10-1025135)

  • 오염방지장치

    Filter tip 하단에 위치한 낙하오염 방지장치는 tip에서 발생되는 에어로졸이 다른 well로 들어가 발생할 수 있는 교차오염을 근본적으로 차단하도록 고안되었습니다.

  • 자동 UV 살균 기능

    장비내부에 장착된 UV 램프를 이용하여 장비내부를 살균할 수 있어 실험에 따른 오염을 막아 더욱 정확한 결과를 얻을 수 있습니다.

  • 편의성

    장비 전면에 장착된 3.5인치 터치 스크린을 이용하여 실험 protocol의 선택 및 UV 살균 등의 기능을 실행할 수 있습니다. 또한, 실험 진행률을 실시간으로 확인할 수 있습니다.

  • 정확성

    0.1 mm 까지 조정 가능한 syringe motor를 장착하여 용액의 자동 분주화 과정에서 발생할 수 있는 오차범위를 최소화 하였습니다. 또한 25 ㎕~1000 ㎕ 부피에서 안정적으로 분주할 수 있기 때문에 다양한 프로토콜에 적용될 수 있으며, 재현성 있는 실험결과를 얻을 수 있습니다.

응용 분야

• Enzyme engineering

• Protein evolution

• Synthetic biology

• Bio-energy R&D

• Protein drug R&D

실험 과정

제품 규격/사양

Dimensions (cm) 32 (W) x 53.5 (D) x 50 (H)
Weight (kg) 27
Temperature range 15-35℃
Humidity range 20-80%, no condensation
Operating system Standalone
User interface 320 x 240 touch screen graphic LCD
Input voltage 100 – 240 VAC
Frequency 50 / 60 Hz
UV sterilization 15 minute cycle
Communications TCP/IP
Heat block 40-90℃

기능

DNA/RNA 추출기능 O
Protein 발현기능 O
Protein 정제기능 O
TFT Touch Screen O
Sample 수 16 samples
자외선 살균 기능 O
Heating & magnetic block O
Cartridge 오염 방지 기능 O
TCP/IP network 연결 N개 장비 연결 가능
Cooling system for sample store O
자동 분주 기능 O
Power supply 24 VDC, 7.5 A(180 W)

* 본 기기의 사양은 제품의 성능 개선을 위해 공지없이 변경될 수 있습니다.

실험 자료

1Protein expression and purification

  • 사용한 DNA 농도: 6 - 10 μg (purity > 1.8)
  • Protocol number : 902
  • Total run time : < 6 h
  • yield : <100 μg

실험 과정

ExiProgen
SDS-PAGE analysis
ExiProgen

<동일 단백질(GFP) 16 well 동시 발현/정제>
Figure 1. GFP protein (His-tagged protein)'s expression/purification with ExiProgen
M; AccuLadder™ Protein Size Maker (Low),
E; expression sample
P; purification sample
ExiProgen <다른 종류 단백질 동시 발현/정제>
Figure 2. His-tagged proteins expression/purification with ExiProgen
M; AccuLadder™ Protein Size Maker (Low)
E; expression sample,
P; purification sample


2Total RNA Extraction From Tissue or cultured mammalian cell

  • Sample: 15 ㎎ (rat liver tissue) or 1 X 106 cells (HeLa)
  • Protocol number: 202
  • Average yield: 25 ㎍ (rat liver tissue), 10 ㎍ (HeLa)
  • Average RQS: 9.5 이상

RQS(RNA quality score): 추출된 RNA의 quality를 수치화하여 나타낸 값으로 각 rRNA 피크의 높이 및 넓이, 분해된 RNA fragment 피크 등을 종합적으로 계산하여 표시합니다. Agilent사에 의해 개발된 RIN(RNA integrity number)와 동일한 개념이며, 보통 0부터 10까지 수치로 나타나는데 10에 가까울수록 RNA의 quailty가 좋은 것으로 판단할 수 있습니다.

실험 과정

ExiProgen

Rat의 조직에서 추출된 total RNA의 분석 결과


ExiProgen

Figure 3. rRNA의 각 subunit이 잘 관찰되는 것으로 보아 total RNA 추출 과정 중 RNA의 분해 없이 intact하게 RNA가 추출된 것을 확인할 수 있습니다.



Rat의 조직에서 추출한 Total RNA를 사용하여 Real-Time PCR을 수행한 결과


ExiProgen

Figure 4. AccuPower® RocketScrpt ™ RT PreMix(K-2101, Bioneer)와 AccuPower® DualStar™ qPCR PreMix(K-6110, Bioneer) 그리고 Exicycler™ 96 Real-Time Quantitative Thermal Block(A-2060)를 이용하여 real time RT-PCR을 수행한 결과입니다.



HeLa cell로 부터 추출한 total RNA의 분석 결과


ExiProgen

Figure 5. HeLa cell (1 X 106 cells)로부터 total RNA를 추출한 후 LabChip GX (Caliper Life Science)를 이용하여 추출된 RNA의 quality를 분석한 결과입니다. rRNA의 각 subunit이 잘 관찰되는 것으로 보아 total RNA 추출 과정 중 RNA의 분해 없이 intact한 RNA가 추출되었음을 알 수 있습니다. 또한, 평균 수율은 10 ㎍이며 평균 RQS는 9.5이상으로 나타났습니다.



HeLa cell로 부터 추출한 total RNA를 사용하여 real-time PCR을 수행한 결과


ExiProgen

Figure 6. HeLa cell (1 X 106 cells)로부터 total RNA를 추출한 후 AccuPower® RocketScrpt ™ RT PreMix (K-2101, Bioneer)와 AccuPower® DualStar ™ qPCR PreMix (K-6110, Bioneer) 그리고 Exicycler™ 96 Real-Time Quantitative Thermal Block (A-2060)를 이용하여 real-time RT-PCR을 수행한 결과입니다.



3Genomic DNA from cultured mammalian cell (HeLa)

  • Sample volume: 1X106 cells
  • Protocol number: 107
  • Total prep time: about 1hr 30min.
  • Average yield: 4-8 μg

실험 과정

ExiProgen

Agarose gel analysis

ExiProgen

Figure 7. Lanes 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15 were extracted with 1X106 cells of cultured HeLa cell and lanes 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16 were extracted with ddH2O as a negative control in DNA extraction. Note all samples have similar yields. Purity was also tested and was consistently between 1.8 and 2.0 (not shown).



4Genomic DNA from bacteria (E.coli)

  • Sample volume: 1X109 cells
  • Protocol number: 109
  • Total prep time: about 1hr 40min.
  • Average yield: 8-12 μg

실험 과정

ExiProgen

Agarose gel analysis

ExiProgen

Figure 8. Lanes 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15 were extracted with 1X109 cells of E.coli cells and lanes 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16 were extracted with ddH2O as a negative control in DNA extraction. Note all samples have similar yields. Purity was also tested and was consistently between 1.9 and 2.0 (not shown).



5Genomic DNA from tissue (bovine skeletal muscle)

  • Sample volume: ~25 mg
  • Protocol number: 102
  • Total prep time: about 1hr 30min.
  • Average yield: Up to 20 µg

실험 과정

ExiProgen

Agarose gel analysis

ExiProgen

Figure 9. Lanes 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15 were extracted with 25 mg of bovine tissues and lanes 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16 were extracted with ddH2O as a negative control in DNA extraction. Note all samples have similar yields. Purity was also tested and was consistently between 1.9 and 2.0 (not shown).



6Genomic DNA from plant tissue (spinach leaf)

  • Sample volume: ~ 100 mg
  • Protocol number: 104
  • Total prep time: about 1 hr
  • Average yield: Up to 5 µg

실험 과정

ExiProgen

Agarose gel analysis

ExiProgen

Figure 10. Lanes 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15 were extracted with 100 mg of spinach leaves and lanes 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16 were extracted with ddH2O as a negative control in DNA extraction. Note all samples have similar yields. Purity was also tested and was consistently between 1.9 and 2.0 (not shown).

Manual

Manual_ExiProgen


Brochure

ExiProgen

Guide book_ExiProgen


Quality Assurance

Bioneer is the holder of Quality Management System Certificates for the following standards.

ISO 9001 - certificate

ISO 13485 - certificate


Technical support

Email: Proteinsupport@bioneer.co.kr


카탈로그 번호 제품명 가격
A-5041 ExiProgen Inquire

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